Η Σχολή Διοίκησης και Οικονομίας του Πανεπιστημίου Θεσσαλίας υλοποιεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών στη "Διοίκηση Επιχειρήσεων" (Master in Business Administration) με τις παρακάτω δύο ειδικεύσεις:
α) Management
β) Marketing
Η διάρκεια του ΠΜΣ πλήρους φοίτησης περιλαμβάνει δύο (2) ακαδημαϊκά εξάμηνα και επιπρόσθετα ένα (1) ακαδημαϊκό εξάμηνο εκπόνησης της μεταπτυχιακής διπλωματικής εργασίας.