Το Τμήμα Γεωπονίας - Αγροτεχνολογίας λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο: «Τεχνολογίες Διαχείρισης Αρωματικών και Φαρμακευτικών Φυτών Καλλιέργεια, Μεταποίηση και Παραγωγή Προϊόντων Υψηλής Προστιθέμενης Αξίας».
Το Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών έχει διάρκεια 3 ακαδημαϊκά εξάμηνα.