Το Τμήμα Κοινωνιολογίας του Πανεπιστημίου Αιγαίου λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο «Μεταναστευτικές Σπουδές: Διαχείριση Μεταναστευτικών Ροών στην Ευρώπη και την Ελλάδα».
Η χρονική διάρκεια του Προγράμματος Μεταπτυχιακών Σπουδών είναι 3 ακαδημαϊκά εξάμηνα.