Το Τμήμα Περιβάλλοντος του Πανεπιστημίου Αιγαίου σε συνεργασία με το Πανεπιστήμιο Κεντρικής Ευρώπης (Αυστρία), το Πανεπιστήμιο του Lund (Σουηδία) και το Πανεπιστήμιο του Μάντσεστερ (Ηνωμένο Βασίλειο) λειτουργούν Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο: "Περιβαλλοντικές Επιστήμες, Πολιτική και Διαχείριση".
Η χρονική διάρκεια του Προγράμματος Μεταπτυχιακών Σπουδών είναι 4 ακαδημαϊκά εξάμηνα.