Το Τμήμα Φαρμακευτικής του Αριστοτελείου λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο: "Φαρμακοχημική και Φαρμακολογική Ανάπτυξη Φαρμακομορίων".
Η χρονική διάρκεια του Προγράμματος Μεταπτυχιακών Σπουδών είναι 3 ακαδημαϊκά εξάμηνα για πλήρη φοίτηση και 6 ακαδημαϊκά εξάμηνα για μερική φοίτηση.