Το Τμήμα Επιστήμης Φυτικής Παραγωγής του Γεωπονικού Πανεπιστημίου Αθηνών οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (Π.Μ.Σ.) με τίτλο: «Ολοκληρωμένα Συστήματα Φυτοπροστασίας και Διαχείρισης του Περιβάλλοντος».
Η χρονική διάρκεια για την απονομή του Μ.Δ.Ε. είναι τρία (3) ακαδημαϊκά εξάμηνα. Τα δύο (2) πρώτα εξάμηνα περιλαμβάνουν τη συμμετοχή των μεταπτυχιακών φοιτητών σε τέσσερα (4) μαθήματα/εξάμηνο και το τρίτο (3ο) Εξάμηνο περιλαμβάνει την εκτέλεση εφαρμοσμένης ή βασικής ερευνητικής διπλωματικής εργασίας.