Το Τμήμα Περιβάλλοντος του Πανεπιστημίου Αιγαίου οργανώνει και λειτουργεί Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα Σπουδών με τίτλο: "Οικολογική Μηχανική & Κλιματική Αλλαγή".
Το ΠΜΣ συνδυάζει φυσική παρουσία (65% των ωρών διδασκαλίας στα μαθήματα του Ά και Β εξάμηνού) και εξ αποστάσεως διδασκαλία (35%) .