Το Τμήματος Κτηνιατρικής του Πανεπιστημίου Θεσσαλίας, σε σύμπραξη με το Τμήμα Τεχνολόγων Γεωπόνων του ΤΕΙ Ηπείρου, υλοποιεί Διϊδρυματικό Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (Δ.Π.Μ.Σ.) με τίτλο «Υδατοκαλλιέργειες - Παθολογικά προβλήματα εκτρεφόμενων υδρόβιων οργανισμών».
Το ΠMΣ απονέμει Δίπλωμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (ΔΜΣ) στις εξής επιμέρους ειδικεύσεις: